Il secondo giorno di prove sul circuito di Phillip Island si chiude con una sorpresa. Stoner solamente terzo segue infatti Dani Pedrosa, autore della pole, e Valentino Rossi. Il catalano alla sua terza pole stagionale dimostra che i progressi in casa Honda sono evidenti seppure la moto giapponese sia gommata “solamente” Michelin. Il vantaggio di Pedrosa in qualifica è significativo, 218 millesimi su Rossi e 6 decimi abbondandi al mattatore della stagione 2007 Casey Stoner; oltre 7 al compagno di squasdra Hayden. Pedrosa col tempo di 1:29.201 è l’unico pilota che avvicina il record della pista siglato dalle 990cc.
Sul passo gara però, Stoner resta il pilota più competitivo; vicini a lui Rossi e Pedrosa. Ecco la griglia di partenza: